（一）五行六气
《伤寒卒病论》，所述不止六气，亦有五行。
《伤寒》以六气为主，《金匮》以五行为主。
（二）脏真
《金匮》之论点，在于脏真，脏真以五行为本，所谓“脏真通与心”“脏真通与脾”等。肺以金为脏真，肝以木为脏真；类此，即五行的气化，亦即五行之真。病邪侵入，先化后气。
脏真与真脏不同，所谓“真脏脉现”者，现于脉，即为真脏。
（三）三阳二阴
五行即五气。《金匮》之五气，即三阳二阴：心为阳中之太阳，肝为阳中之少阳，肺为阳中之太阴，此属三阳；脾为阴中之阴，肾为阴中之少阴，此属二阴。
《金匮》以三阳二阴为主，《伤寒》以三阳三阴为主。
